Desde 1989, o Centro de Monitoramento Ambiental da Serra do Itapety - Cemasi desenvolve projetos de pesquisa em conservação da biodiversidade, distribuídos principalmente nas regiões do Alto Tietê e do Vale do Paraíba no Estado de São Paulo.
Tais projetos visam contribuir para o conhecimento da diversidade biológica,
essencial a práticas de manejo, e programas de educação ambiental para áreas
naturais protegidas como Parques Naturais Municipais, Áreas de Proteção
Ambiental e Reservas Particulares, que encontram-se no denominado Corredor
Ecológico Sul da Mata Atlântica ( As Serras da Mantiqueira e do Mar e os
remanescentes de vegetação e fauna nativas entre estas áreas ).
Este Corredor Ecológico é considerado pelo Governo Federal como uma das áreas mais viáveis para a conservação de todos os remanescentes de Mata Atlântica do Brasil.
As áreas estudadas pelo Cemasi no Alto Tietê e Vale do Paraíba, somam 28 remanescentes do bioma da Mata Atlântica com dimensões que variam entre 1 e 10.000 hectares de vegetação contínua (floresta ombrófila densa, encraves de cerrado, escrube, campos e mata de araucária) localizadas em 21 municípios .
Nos estudos já realizados, foram efetivadas inúmeras coletas para a organização de coleções botânicas (herbário de fanerógamas e pteridófitas) e coleções zoológicas (mastozoologia, ornitologia, herpetologia, ictiologia, aracnologia e entomologia).
Este acervo, forma uma coleção de referência, pois além dos objetivos básicos das pesquisas que a produziram, a mesma possui exemplares de regiões no Estado de São Paulo onde a diversidade biológica é ainda pouco conhecida.
A
Fundação SOS Mata Atlântica em parceria com o Cemasi, implementam o Museu de
História Natural do Alto Tietê e Vale do Paraíba, no campi César de
Souza da Universidade Braz Cubas, município de Mogi das Cruzes,.